A Madagascar, l’agriculture représente le premier secteur économique, contribuant à environ 27% du PIB.  Dans le secteur agricole, la riziculture occupe la première place, pratiquée en 2003 par 73% des ménages ruraux (MEFB, 2004). Toutefois, la consommation per capita est passée de 150 kg en 1980, à uniquement 114 kg/personne/an en 1999 (UPDR/FA0, 2000) traduisant une forte difficulté à satisfaire la demande liée au taux annuel de progression démographique de 3,5 %. La production pluviale, dont tout particulièrement le riz qui vient en rotation avec le Maïs, le manioc, les légumineuses à graines ou les fourrages plantés, a donc récemment pris de l’essor dans les régions de moyenne et haute altitude (de 700 à 1800 m) de ce pays. La durabilité des systèmes de production dans ce type de zones soulève des questions tout à fait spécifiques. En effet, le climat plus froid qui s’accentue surtout au dessus de 1000m d’altitude n’est pas favorable à la production de biomasse tout au long de l’année et peut même s’avérer fortement limitant pour certaines cultures comme le riz par exemple. Les sols sont peu fertiles, et rapidement dégradés sur les pentes.  Les exploitations sont de petite taille et les producteurs ont généralement un accès très limité aux intrants externes et au crédit. En revanche, l’élevage est une composante importante de capitalisation, voire d’intensification lorsqu’il se spécialise vers la production laitière. Les articulations entre les cultures et l’élevage plus ou moins intensif au niveau des exploitations conditionnent les processus d’innovation agissant sur l’évolution des systèmes de production et leur durabilité.

Il y a une longue tradition de collaboration scientifique entre le Cirad et les institutions de recherche malgaches, en particulier dans le domaine de la riziculture d’altitude, touchant tant la création variétale que la gestion durable de la riziculture pluviale. Cette collaboration s’est traduite à partir de 2001 par la formation de SCRiD (Systèmes de Culture et riziculture durable), collectif de recherche commun Fofifa-Université d’Antananarivo-Cirad, spécialisé autour de la durabilité de la riziculture pluviale. Ce collectif est passé par différents statuts de collaboration partenariale (PCP, URP, dP) et perdure comme un axe fort de collaboration en recherche agronomique entre ses membres. Toutefois la problématique sur les zones malgaches de moyenne à haute altitude ainsi que l’énorme besoin du secteur agricole pour s’adapter à un contexte économique très contraint nous ont amenés à élargir le champ de cette coopération avec en 2013 Fifamanor et l'IRD et l'intégration en 2015 d'Africa Rice.